Większość spotykanych na rynku czytników pozwala wyświetlać tekst i obrazy oraz odtwarzać nagrania. Wśród obsługiwanych formatów znajdują się między innymi:
pliki tekstowe (.txt) jest to zwykły, niesformatowany tekst. Żadne elementy nie są wyróżnione: nagłówki i tytuły wyglądają tak samo, jak reszta tekstu. Dokumenty tekstowe dobrze wyświetlają się na ekranie, strony zmieniają się szybko, ale niektóre urządzenia mogą nie wyświetlać poprawnie polskich znaków;
dokumenty sformatowane (.pdf) format PDF został opracowany przez firmę Adobe Systems, a następnie uznany przez organizację ISO jako standard wymiany dokumentów (Portable Document Format – format dokumentu przenośnego). Najważniejszą cechą jest zachowanie formatowania, co oznacza, że dokument PDF wygląda tak samo na każdym urządzeniu: komputerze, drukarce, plotterze itp. Zachowane są czcionki, wygląd tytułów i nagłówków, rozmiar i umiejscowienie rysunków. Niestety, to co jest zaletą w przypadku komputerów – niekoniecznie musi się sprawdzać na czytnikach elektronicznych. Na małych ekranach tekst może być nieczytelny, a przy powiększeniu strona przestaje się mieścić na ekranie, przez co czytanie przestaje być wygodne. Ponadto, przewijanie stron może się zauważalnie wydłużać w przypadku bardziej złożonych dokumentów;
mobipocket (.prc): to obecnie najbardziej popularny format stosowany w e-książkach. Stworzony w roku 2000 przez francuską firmę Mobipocket SA aby umożliwiać dystrybucję cyfrowych książek na przenośne organizatory (PDA), smartfony oraz e-czytniki. Inaczej niż w przypadku pdf, czytelnik może sam wybrać rodzaj i wielkość czcionki a tekst dopasowuje się automatycznie do wielkości ekranu. W rezultacie ten sam dokument może inaczej wyglądać na różnych urządzeniach. Dokument zawiera podstawową informację o formatowaniu tekstu – paragrafach, nagłówkach, wyróżnieniach – co z kolei odróżnia go od formatu tekstowego. Publikacje w formacie mobipocket mogą być zabezpieczone przed kopiowaniem na inne urządzenia, dlatego format ten jest chętnie wybierany przez wydawców elektronicznych książek.
EPUB (Electronic PUBlication) jest standardem zalecanym przez stowarzyszenie IDFP (International Digital Publishing Forum – Międzynarodowe Forum Wydawnictw Cyfrowych). Jest to darmowy i otwarty format oparty na opisie XHTML. Podobnie jak w przypadku mobipocket, dokument zawiera podstawowe informacje o formatowaniu a tekst automatycznie dopasowuje się do rozmiarów wyświetlacza. Mimo, że oferta cyfrowych książek w formacie EPUB jest dziś uboższa niż mobipocket, znaczenie tego standardu rośnie i kolejni producenci włączają jego obsługę do swoich urządzeń. E-książki w formacie EPUB mogą być ogólnie dostępne lub zabezpieczone przed kopiowaniem specjalną technologią firmy Abobe Systems.
fictionbook (.fb2) to otwarty format oparty na opisie XML stosowany do zapisu ebooków, szczgólnie popularny w Rosji. Nie jest to specyfikacja wyglądu dokumentu, ale raczej opis jego struktury: rodziałów, paragrafów, wyróżnień itp. za pomocą odpowiednich znaczników. Z tego względu, format ten może być stosowany jako materiał wyjściowy do kowersji na inne formaty (epub, mobipocket itp.).
pliki graficzne (.jpg, .png, .tiff, .bmp) czytniki mogą wyświetlać zdjęcia i obrazy, jednak ze względu na ograniczenia technologii e-papieru prezentowane obrazy są przedstawione jedynie w odcieniach szarości.
pliki dźwiękowe (.mp3)czytniki mają tez możliwość odtwarzania na słuchawkach plików dźwiękowych. Dzięki temu, czytając możemy słuchać muzyki. Można też, zamiast czytania tradycyjnej książki, wysłuchać książki dźwiękowej – tak zwanego audiobooka.